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崗位職責(zé)：
1、搭建微生物代謝模型構(gòu)建、FBA 分析、機(jī)器學(xué)習(xí)建模的自動化流程（基于 Python/Shell 腳本），編寫SOP 文檔
2、負(fù)責(zé)實驗數(shù)據(jù)（如菌株促生數(shù)據(jù)、田間降解數(shù)據(jù)）、模型文件、分析結(jié)果的歸檔管理，撰寫項目分析報告，向研發(fā)團(tuán)隊同步模型預(yù)測結(jié)論及田間應(yīng)用建議。?
3、與實驗團(tuán)隊協(xié)作明確模型校正需求；優(yōu)化菌株與作物的互作代謝模型；配合 AI 算法團(tuán)隊優(yōu)化農(nóng)業(yè)場景下的模型輸入特征。?
4、跟蹤代謝建模前沿技術(shù)（如新型農(nóng)業(yè)微生物 GEM 重構(gòu)算法、AI 驅(qū)動的作物 - 微生物互作模型），評估并引入適配工具（如耐逆菌株代謝模型專用插件、農(nóng)業(yè)多組學(xué)數(shù)據(jù)整合工具）。
崗位要求：
1、碩士及以上學(xué)歷，生物信息學(xué)、計算生物學(xué)、農(nóng)業(yè)生物技術(shù)、微生物學(xué)、生物工程等相關(guān)專業(yè)；1-3 年生物信息學(xué)相關(guān)工作經(jīng)驗，至少 1 年農(nóng)業(yè)微生物代謝模型構(gòu)建或多組學(xué)分析經(jīng)驗；應(yīng)屆生需具備農(nóng)業(yè)微生物 GEM/FBA 相關(guān)畢業(yè)設(shè)計或科研項目經(jīng)驗。
2、熟練基因組尺度代謝模型（GEM）構(gòu)建方法，有農(nóng)業(yè)微生物（如根瘤菌、芽孢桿菌、降解菌）GEM 構(gòu)建經(jīng)驗者優(yōu)先，能獨立使用 COBRApy、ModelSEED 等工具，熟悉 SBML 模型格式及農(nóng)業(yè)微生物專屬數(shù)據(jù)庫（如 Rhizobase、AGRICOLA）。?
3、掌握通量平衡分析（FBA）原理與操作，能使用 Gurobi/GLPK 執(zhí)行 FBA 計算，有農(nóng)業(yè)場景下 FBA 應(yīng)用經(jīng)驗（如生物肥料菌株代謝優(yōu)化、秸稈降解菌通量分析）者優(yōu)先。?
4、具備機(jī)器學(xué)習(xí)建模能力，熟練使用 Scikit-learn、TensorFlow/PyTorch 構(gòu)建隨機(jī)森林、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型，能處理農(nóng)業(yè)多組學(xué)數(shù)據(jù)（如根際微生物組、土壤代謝組），有農(nóng)業(yè)功能預(yù)測模型開發(fā)經(jīng)驗者優(yōu)先。?
5、熟練使用 Python（Pandas、NumPy、Matplotlib）、R 等數(shù)據(jù)分析工具，具備 Shell 腳本編寫能力，能搭建自動化分析流程；熟悉 Linux 操作系統(tǒng)，有高通量測序數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗者優(yōu)先。
6、了解理性設(shè)計 AI 技術(shù)（如強(qiáng)化學(xué)習(xí)）在微生物改造中的應(yīng)用，能參與改造方案的 AI 設(shè)計與驗證
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